Сергей Наперковский – воспитанник СДЮШОР-3 Пинск. Игровую карьеру футболиста начал в Пинском ФК “Коммунальник” в 1996 году, далее были ФК “Пинск-900” (1997-1999, 2005), ФК “Динамо-Брест” (2000-2000), ФК “Гранит” Микашевичи (2003-2004), ФК “Волна-Пинск” (2006-2011). С 2015 по 2016 года возглавлял молодёжную команду “Чёрные пантеры”.

С 2017 по 2020 год работал в Академии футбола “Динамо-Брест” тренером молодёжных команд.